
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC免疫抗体聚集MHC以至于结合实际肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫抗体肽队列并且 翻譯后掩盖新信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从早测序系统,不依赖现有数据库,比较高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多样化的动态数据了解內容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递恶性肿瘤抗原的路线
NO.1 实践操作流程
NO.2 的产品特征
NO.3 具体分析方式(个部分)
NO.4 送样意见建议
装修案例分析报告一下
01 制度化探析
新闻稿件标题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
投稿期刊:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)也是种核輸出核蛋白,在癌证中频繁过体现,做以为淋巴肿瘤会出现的能够主观因素。到目前为止,靶向疗法XPO1的小大分子正被用在药学防癌药剂。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用天然免疫肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 的来源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 良性肿瘤-免疫性医疗
稿件题目的:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
刊出期刊杂志:Nature Communications IF:16.6 2023
恶性恶性肿瘤胸膜间皮瘤(MPM)都是种生存率不正常的入侵性恶性肿瘤。考虑到主要的医疗方法匮乏效用,因紧迫要有新的医疗攻略。因为其T血细胞浸润性,小编假定MPM都是个适合使用的医疗性肠癌接种疫苗的阶段目标。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用鉴于质谱的免疫力肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶变胸膜间皮瘤抗体肽组学论文检测
03 细菌病毒mRNA防疫针開發
好文章之类:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
收录报刊内容:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过体系结构质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌感化的Hela神经元和HCT-116神经元中鉴别MHC I呈递的抗原肽。
拜谱工作小结
免役受损肿瘤体細胞检测性肽组学是淀粉酶质组学的某个快捷快速发展的树状,它细心于实验免役受损肿瘤体細胞检测性整体中由具体组织结构开展相匹配性复合型体(MHC)或人类白神经受损肿瘤体細胞抗原(HLA)原子呈递的免役受损肿瘤体細胞检测性肽。以上免役受损肿瘤体細胞检测性肽是神经受损肿瘤体細胞从表面呈递的肽段,才可以被T神经受损肿瘤体細胞认别,然后解锁免役受损肿瘤体細胞检测性反馈。依据质谱的免役受损肿瘤体細胞检测性肽组学就为监定MHC淀粉酶呈递肽的金规格方式,才可以会直接监定有差异生物学和病症模式下有差异组织结构开展和神经受损肿瘤体細胞方式中的免役受损肿瘤体細胞检测性肽组,诸如实体店瘤或细菌沾染的神经受损肿瘤体細胞。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的球蛋白组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免役肽组测试贴心服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,都可以精确且直接性给予天然免疫抗体肽字段,出现多非典例天然免疫抗体肽,落实责任建立出准确新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参考价值专著
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y