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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力动物群特喜欢的人、寡核苷酸绘制成本预算比较高或操作的步骤流程很复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教导销售团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个成本更低价、跨植物物种、全电商平台兼容的全新解决方案。

刊物间介

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我们内地有效实训基地显性基因与胸部发育生态学工程学实验所和我们内地显性基因法学会牵头的展览学术讨论交流刊物,强院于报导生命是什么有效学和医药学显性基因学区域的爱创新性实验工作成效。JGG 202多年度危害系数7.1,Scopus学术讨论交流刊物评分指数公式CiteScore 9.9,跃居JCR 202多年度GENETICS & HEREDITY区域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY区域Q1区,跃居我们内地有效实训基地刊物分区域生态学工程学商品类别1区(Top刊物),显性基因学和生物制品化与团伙生态学工程学小类双1区。

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啥是HEATag

婉转的“二合二为一”开发

HEATag是由凝集素和HUH内切酶制成的整合淀粉酶

「确定器」功能模块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化呈现(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「进行电源连接器」摸块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)检索条状码参与共价相连接。

“1+1>2”的体验:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样板标记图片与溯源系统。

Fig1: HEATag很多符号设计原理示图图

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实用技巧检定

HEATag倒底有点能打?

可不可以在有所不同必备条件下,完成辅乳动植物肿瘤肿瘤细胞系单肿瘤肿瘤细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。研究方案组织为 HEATag 如何设置了多轮 “重压測試”,从内部系到内部核,从常温下到底温,从新鲜样板到固定的样板,全位子查验它的动态平衡性和可以信赖性。

第二轮测试英文造成喂乳昆虫人体細胞核系:科学研究员采用了出自人、鼠、仓鼠6个种群的三种人体細胞核(HEK293T、K562、MEF、CHO),在常温下使用 HEATag 标注后比调测序。决定性出售的 11447 个人体細胞核中,85.66% 都能凭借 HEATag 方形码精确识别到原种群,子样本间交叉式污染破坏特少,UMAP 聚类浅析法浅析更要直接性证明信,HEATag 方形码与种群特情人表观遗传组功能位置同步。 之后,检测生活生活先决条件进那步自动升级:的研究人数试穿在 4℃下标示新鲜毛肚毛肚血人体组织、在制冷下标示甲醇统一血人体组织,而且简单标示血人体组织核。报告始终出众:所以生活生活先决条件下,样版性子与植物物种个人信息均享有很不错的一些性,转换精准的率超 95%。虽然甲醇统一会致使偶尔的转录本双向废弃物,血人体组织核备制可能会有一定量 RNA 外流,血人体组织结构类型的参考文献标注报告始终与新鲜毛肚毛肚样版长期保持相符,表明 HEATag 能够标示的不同处里生活生活先决条件下的进行实验样版。

Fig2: HEATag 可在有差异先决条件下提交单神经元转录组混样讲解

要能标记图片哺乳期哺乳动植物和海洋能无脊梁骨哺乳动植物的原代肿瘤细胞

假设说细胞系系系检验是 “基础性题”,那组织安排样版正是 “增加题”, 哪些样版一般因细胞系系类行麻烦、场景适应能力性特别,变成了标记图片技术水平的 “瓶颈问题”,而 HEATag 正好在哪些 “瓶颈问题” 上突显了强势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组建,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞一方面能被最准确判别,大多数包括生殖细胞款式的聚类分析成果都明显可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海域海洋生物的更换性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与植物物种转录组更具较高不对性,就没有出现了因高盐环境形成的 “记号失灵”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可保持母乳喂奶動物企业范例多大 scRNA-seq 研究

Fig4: HEATag可实行新鲜的海洋生物无脊椎骨各种动物多个 scRNA-seq 概述

HEATag与组织的配合不是致使转录组的显著性变化

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在进行箭头目标任务的直接,会对事件调查的转录类物质析从而造成侵扰,有保障了研究分析数据信息的真人真事性。

Fig5: HEATag不要影晌范例的 RNA 表明模式切换

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中国来日可期

HEATag 能为单細胞探析引致甚么?

HEATag 的价值量,远不断于 “彻底解决标出故障”,它的灵敏性和共通性,正为单人体细胞钻研浏览器打开更好能够性

从采用场地来说

HEATag 能遍布从 “单纯会比较剖析”(如癌团体与平常团体、用药工作与剖析)到 “广泛较论述”(如团体组织系图谱建模、mtk量淘汰)的全条件所需。根据 PIP-seq、Stereo-cell 等新颖可存储系统的不断发展,HEATag 还能进第一步提高自己单组织系论述的通量,保驾护航教学科研专业团体推进更广泛较的顶目。

从跨领域能力分析

HEATag 不但适用性于转录组学,还能与表观染色体组学、球胆固醇组学、前景组学等能力结合在一起,在定制开发字段和寡核苷酸字段,HEATag 能够 更好融入到差异的组学具体步骤,不应响表现采集深度1。同一,针对HEATag还能够 发展趋势单癌细胞糖组学实验能力。

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达成合作动态展示

拜谱海洋生物与陈凯传授实现目标大概相互合作购房意向

适合关心的是,在 HEATag 水平塑造出较大应运潜质的底色下,拜谱海上菌物系统APP已与我国南方海上海上菌物科学有效与工程项目广东市测试性室(广东)陈凯院士实现第一次合作共赢有意向。买卖双方运作计划包围 HEATag 水平的财产化离地、研发管理转换成等方问生成深层协同运作,深入推进相应低料工费、跨种群的单血神经元标记符号水平更加迅速应运于实践研发管理画面,为更加多测试性室出具高效能、市场经济的单血神经元科学研究产品,转向研发管理运我们在血神经元海上菌物系统APP学、海上海上菌物海上菌物系统APP学、症状体系等这个领域认定更加多冲破
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